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            [ 69 Rhône ]   [LYON] Recherchons Bio-informaticien
93 connectés(record : 2799 le 29 May 2016 - 15 h 34)

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[ 69 Rhône ]   [LYON] Recherchons Bio-informaticien

oniiychan


Messages : 412
Inscrit le 02/02/10
Ville : Lyon
Non connecté
  Posté le 29 September 2014 - 20 h 45 m 05 s
Bonjour à tous,

Nous voici donc à la recherche d'un bio-informaticien.
Le poste est à pourvoir immédiatement.

La description du poste suit :



Bio-informaticien

Type de contrat : CDI

Ville: LYON

Laboratoire:
VIROSCAN3D, PME

Nom du contact: Catherine Legras-Lachuer, CEO ViroScan3D

Email du contact: catherine.lachuer@viroscan3d.com

Date de validité: 01/10/2014



Description du poste:

Viroscan3D ( http://www.viroscan3d.com/ ) est une jeune société innovante proposant des prestations de service et de R&D de génomique en infectiologie (recherche de pathogènes, identification de bio-marqueurs) à l’aide de technologies haut débit (séquençage nouvelle génération, microarrays).
Son activité est adossée à la plateforme de génomique Profilexpert de l’Université Lyon1.

Viroscan3D recrute un bio-informaticien qui sera chargé de l’analyse de données issues du séquençage NGS et de microarrays dans le cadre des projets de prestation de services de la société.

Mission:

Dans le cadre de votre activité au sein de la société vous serez impliqué dans :

- Le contrôle de la qualité des données obtenues ainsi que la rédaction du rapport qualité.
- La réalisation des analyses bio-informatiques des données moléculaires issues de technologies de génomique (séquençage nouvelle génération, microarrays).
Vous serez notamment amené à réaliser des analyses de transcriptome), génotypage (CGH, altération moléculaires diverses), épigénome (méthylation de l’ADN, ChIP-seq, MiRNome, ChIP-on-chip, RRBS…), métagénomique (microbiomes (amplicons 16S, viromes) ainsi que des assemblages de séquences (séquençage De novo ou re-séquençage).

- La rédaction du rendu de résultats des analyses réalisées.
- La veille scientifique afin de participer à la définition des stratégies d’analyse, de développement et d’évolution de l’activité au sein de la société.
- La gestion du parc informatique.

Pour cela vous serez amené à :

- Utiliser des logiciels d’analyse commerciaux d’extraction de données issues du séquençage NGS associés à la technologie Illumina et des puces à ADN associé à la technologie Affymetrix et Illumina ou d’analyse tels que Ingenuity Pathway Analysis ou Partek, Galaxy, baseSpace.
- Définir les solutions analytiques à mettre en place pour répondre aux problématiques des clients et effectuer des développements (programmation) le cas échéant.
- Créer et interroger des bases de données.


Profil:

Compétences
- Niveau Bac+5 en bio-informatique de formation universitaire ou équivalente. Une expérience antérieure en génomique et plus particulièrement en analyse NGS est un plus.
- Les formations Bac+3 avec une expérience significative (3 ans minimum) en analyse NGS seront considérées.
- Maitrise de plusieurs langages de développement et programmation parmi R, Java, Perl (CGI, perl objet), PHP, Html, Javascript, C++, Python, Shell…
- Connaissance des algorithmes pour l’analyse des données Illumina (CASAVA, TopHat, Bowtie etc..) est un plus.
- Compétences de gestion, développement et intégration de base de données relationnelles de type SQL
- Des bases en biologie moléculaire (concepts à la base du transcriptome, du génome et de l’épigénome, séquences et structure des gènes, , bases de données ENSEMBL, NCBI, UCSC, UNIPROT etc..) sont fortement appréciées. Notion en infectiologie sera un plus.
- Des connaissances en statistiques sont un plus.
- Communication écrite et orale, anglais nécessaires
Qualités personnelles
- Autonomie, rigueur, sens de l’organisation et capacité à s’investir dans une équipe, un projet,
- Sens de la communication et du relationnel, capacité à travailler en équipe,
- Interaction multidisciplinaire


Informations contractuelles:

CDI. Début : dès que possible.
Rémunération selon profil et expérience


Avantages sociaux:

Forfait transport, tickets repas,
Complémentaire santé, plan de prévoyance, retraite complémentaire

Contact :
Envoyer CV et lettre de motivation à en mentionnant la référence suivante «IBI 140613» en l’objet du mail à catherine.lachuer@viroscan3d.com.




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